8. 本產(chǎn)品只能用于科研。
規(guī)格及成分
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成分
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規(guī)格
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包裝
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探針法qRT-PCR緩沖液
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500μL
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0.5mL藍蓋管
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探針法qRT-PCR酶混合液
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100μL
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0.5mL紅蓋管
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熒光PCR專用模板稀釋液
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1mL
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1.5mL綠蓋管
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MS2病毒-SM3病毒RT-PCR引物-探針干粉(含內(nèi)參探針)
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50次
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0.5mL棕色管
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MS2病毒陽性對照(1×10E7拷貝/μL)
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50μL
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0.5mL黃蓋管
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MS3病毒陽性對照(1×10E7拷貝/μL)
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250μL
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0.5mL白蓋管
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使用手冊
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1份
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1份
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本產(chǎn)品采用十孔盒包裝
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注 意:引物-探針干粉(含內(nèi)參探針)在使用前需要短暫離心,然后在離心管中加入220uL的超純水充分混勻后再使用,未用完的需要-20℃保存。
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使用方法
稀釋含內(nèi)參的SM2病毒檢測標準曲線樣品以陽性對照10E1-10E6拷貝/μL這6個10倍稀釋度和內(nèi)參固定在10E3拷貝/μL為例
由于標準品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分。
1. 標記6個離心管,分別為6,5,4,3,2,1,0。
2. 在0號管中加入280μL熒光PCR專用模板稀釋液,35μL本試劑盒提供的內(nèi)參,震蕩一分鐘混勻。內(nèi)參的濃度為1111拷貝/μL。
3. 用帶芯槍頭分別將上步得到的混合液按45μL/管加入到標記的1-6號管中,每管中含內(nèi)參50000拷貝。用帶芯槍頭(下同)。
4. 在6號管中加入5 μL 1×10E7拷貝/μL 的陽性對照(試劑盒提供),充分震蕩1分鐘,得1×10E6拷貝/μL的標準曲線PC樣品。放冰上待用。
5. 換槍頭,在5號管中加入5 μL 1×10E6拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E5拷貝/μL的標準曲線樣品。放冰上待用。
6. 換槍頭,在4號管中加入5 μL 1×10E5拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E4拷貝/μL的標準曲線樣品。放冰上待用。
7. 重復上面的操作直到得到6個稀釋度的標準曲線陽性樣品,每個樣品中內(nèi)參的濃度固定為10E3拷貝/μL,總拷貝數(shù)為5×10E4。放冰上待用。
稀釋含內(nèi)參的SM3病毒檢測標準曲線樣品
8. 操作同上,只是使用SM3病毒的PC作為模板。得到6個濃度的樣本放冰上待用。
樣品RNA的制備
9. 如果有N個樣品,設置N+3個提取,多出的一個是SM2病毒的PC(樣品制備陽性對照),多出的一個是SM3病毒的PC(樣品制備陽性對照),一個是NC(樣品制備陰性對照)??梢杂?0μL第一步和第二步所得的兩個4號稀釋液再加上一定量的水使總體積跟樣本制備試劑盒所要求的樣本體積一樣,以此分別作為兩個PC。另外用水作為NC,水和內(nèi)參的總體積需要跟樣本制備試劑盒所要求的樣本體積一樣。
10. 用自選方法純化樣品的RNA(含內(nèi)參),本試劑盒跟市場上大多數(shù)RNA提取試劑盒兼容,也可以選購本公司的免提取核酸釋放劑。
Probe qRT-PCR反應20μL體系,在樣品制備室進行
11. 如果做定量分析并且只做1次重復,則標記N+3+1+6+6個RT-PCR管,其中N+3個用于上步得到的N+3個樣品,1個用于RT-PCR陰性對照(用水做模板),6個用于SM2病毒的標準曲線,另外6個用于SM3病毒的標準曲線。如果做定性分析并且只做1次重復,則標記N+3+3個RT-PCR管,其中N+3個用于上步得到的N+3個樣品,1個用于RT-PCR陰性對照(用水做模板),1個用于SM2病毒RT-PCR陽性對照,1個用于SM3病毒RT-PCR陽性對照(直接用第一步和第二步所得的兩個4號稀釋液作為模板)。下面只以定量分析為例描述操作步驟。
數(shù)據(jù)處理
1. 如果擴增陽性對照或制備陽性對照結果為陰性,則整個擴增或制備實驗無效,不需要分析數(shù)據(jù),需要重做擴增或制備或跟廠家聯(lián)系。如果擴增陰性對照或制備陰性對照結果為陽性,說明環(huán)境污染,則整個擴增或制備實驗無效,不需要分析數(shù)據(jù),需要跟廠家聯(lián)系,購買新的引物和探針。
2. 如果陰性對照和陽性對照正常,則實驗有效,可以進入后續(xù)分析。
3. 對定量檢測,以標曲樣本濃度的log值為橫軸,分別以SM2病毒陽性對照(FAM通道)和SM3病毒陽性對照(HEX通道)的Ct值為縱軸,繪制兩條標準曲線,r2必須大于0.95。再以待測樣品的Ct值從分別從兩條標準曲線上推算出對應樣品RNA濃度的log值,再推算出其濃度。
4. 對定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照FAM通道的Ct必須大于或等于40。陽性對照FAM通道的熒光信號必須有對數(shù)增長,有典型擴增曲線,Ct值應該小于或等于35。對待測樣品,如果其FAM通道的Ct大于或等于40則為SM2病毒陰性,如果小于或等于35則為SM2病毒陽性。如果其HEX通道的Ct大于或等于40則為SM3病毒陰性,如果小于或等于35則為SM3病毒陽性。如果在35-40之間,則重復一次。重復實驗的Ct值如果大于或等于40則為陰性,如果小于40,則為陽性。
自備試劑
樣品RNA
運輸及保存
低溫運輸,-20℃保存,有效期1年