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大腸桿菌細(xì)胞基因組DNA殘留探針?lè)╭PCR試劑盒
產(chǎn)品及特點(diǎn)
產(chǎn)品及特點(diǎn)
大腸桿菌是生物制品生產(chǎn)中應(yīng)用較為廣泛的宿主細(xì)胞之一。理論上，存在于生物制品中的微量DNA雜質(zhì)都可能轉(zhuǎn)導(dǎo)異源基因到人體細(xì)胞，導(dǎo)致癌變或其他病理變化。因此，中國(guó)藥典2020年版三部規(guī)定，以細(xì)胞基質(zhì)生產(chǎn)的生物制劑DNA殘留量不能超過(guò)100pg/劑，以細(xì)菌或真菌基質(zhì)生產(chǎn)的疫苗DNA殘留量不能超過(guò)10fg/劑。由于宿主細(xì)胞DNA殘留量的控制是生物制品質(zhì)量控制中非常重要的環(huán)節(jié)，因此本公司基于熒光定量PCR技術(shù)，開(kāi)發(fā)了專(zhuān)門(mén)用于檢測(cè)樣品中大腸桿菌細(xì)胞基因組DNA殘留的本產(chǎn)品，它具有下列特點(diǎn)：
1. 即開(kāi)即用，用戶(hù)只需要提供樣品DNA模板。
2. 引物和探針經(jīng)過(guò)優(yōu)化，分析靈敏性高，可以達(dá)到0.1fg/反應(yīng)。
3. 提供陽(yáng)性對(duì)照，便于區(qū)分假陰性樣品。
4. 特異性高，引物和探針是根據(jù)大腸桿菌細(xì)胞基因組DNA高度保守區(qū)設(shè)計(jì)，不會(huì)跟其他生物的DNA發(fā)生交叉反應(yīng)。
5. 既可用于定性檢測(cè)，又可用于定量檢測(cè)。用于定量檢測(cè)時(shí)線(xiàn)性范圍至少為5個(gè)數(shù)量級(jí)。
6. 本產(chǎn)品足夠50次20μL體系的探針?lè)晒舛縋CR反應(yīng)。
7. 本產(chǎn)品只能用于科研。
規(guī)格及成分
規(guī)格及成分
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成分 |
規(guī)格 |
包裝 |
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2×Probe qPCR MasterMix |
0.5mL |
0.5mL本色蓋 |
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熒光PCR專(zhuān)用模板稀釋液 |
1mL |
1.5mL綠色蓋 |
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探針?lè)?/span>qPCR特異性增強(qiáng)劑 |
1mL |
0.5 mL藍(lán)蓋管 |
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大腸桿菌細(xì)胞基因組DNA殘留qPCR引物-探針干粉 |
50次 |
1.5mL棕色管 |
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大腸桿菌細(xì)胞基因組DNA殘留qPCR陽(yáng)性對(duì)照(100pg/μL) |
50μL |
0.5mL黃色蓋 |
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使用手冊(cè) |
1份 |
無(wú) |
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本產(chǎn)品采用五孔盒包裝 |
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注 意：引物-探針干粉在使用前需要短暫離心，然后在離心管中加入165 μL的超純水充分混勻后再使用，未用完的需要-20℃保存。 |
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使用方法
稀釋標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)樣品以10pg-0.1fg/μL這6個(gè)10倍稀釋度為例
由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高，因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行，千萬(wàn)不能污染樣品或本試劑盒的其他成分）。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原，本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽(yáng)性對(duì)照，只提供無(wú)傳染性的DNA片段作為陽(yáng)性對(duì)照。
由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高，因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行，千萬(wàn)不能污染樣品或本試劑盒的其他成分）。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原，本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽(yáng)性對(duì)照，只提供無(wú)傳染性的DNA片段作為陽(yáng)性對(duì)照。
1. 標(biāo)記6個(gè)離心管，分別為6，5，4，3，2，1。
2. 用帶芯槍頭分別加入45 μL 熒光PCR專(zhuān)用模板稀釋液，用帶芯槍頭，下同）。
3. 在6號(hào)管中加入5 μL 1×100pg/μL的陽(yáng)性對(duì)照(試劑盒提供)，充分震蕩1分鐘，得1×10pg/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)樣品。放冰上待用。
4. 換槍頭，在5號(hào)管中加入5 μL 1×10pg/μL的陽(yáng)性對(duì)照(上步稀釋所得)，充分震蕩1分鐘，得1pg/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)樣品。放冰上待用。
5. 換槍頭，在4號(hào)管中加入5 μL 1pg/μL的陽(yáng)性對(duì)照(上步稀釋所得)，充分震蕩1分鐘，得100fg/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)樣品。放冰上待用。
6. 重復(fù)上面的操作直到得到從10pg/μL到0.1fg/μL 共6個(gè)稀釋度的標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)樣品。放冰上待用。
樣品DNA的制備
7. 如果有N個(gè)樣品，設(shè)置N+2個(gè)提取，多出的一個(gè)是PC（樣品制備陽(yáng)性對(duì)照），一個(gè)是NC（樣品制備陰性對(duì)照）?？梢杂?0μL上步所得4號(hào)稀釋液再加上一定量的水使總體積跟核酸制備試劑盒所要求的起始樣本體積一樣，以此作為PC。另外用水作為NC。
8. 用自選方法純化樣品的DNA，本試劑盒跟市場(chǎng)上大多數(shù)樣品DNA提取試劑盒兼容。也可以選購(gòu)本公司的相關(guān)產(chǎn)品或免核酸提取樣本釋放劑。
Probe qPCR反應(yīng)20μL體系，在樣品制備室進(jìn)行
9. 如果做定量分析并且只做1次重復(fù)，則標(biāo)記N+9個(gè)PCR管，其中N+2個(gè)用于上步得到的N+2個(gè)樣品，1個(gè)用于PCR陰性對(duì)照（用水做模板），6個(gè)用于標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)。如果做定性分析并且只做1次重復(fù)，則標(biāo)記N+4個(gè)PCR管，其中N+2個(gè)用于上步得到的N+2個(gè)樣品，1個(gè)用于PCR陰性對(duì)照（用水做模板），1個(gè)用于PCR陽(yáng)性對(duì)照（直接用第6步第4號(hào)管的陽(yáng)性對(duì)照稀釋液做模板）。下面只以定量分析為例描述操作步驟。
數(shù)據(jù)處理
1. 陽(yáng)性對(duì)照濃度的log值為橫軸，以Ct值為縱軸，繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)。再以待測(cè)樣品的Ct值從標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)上推算出樣品DNA濃度的log值，再通過(guò)樣品DNA濃度的log值推算出其濃度。
數(shù)據(jù)處理
1. 陽(yáng)性對(duì)照濃度的log值為橫軸，以Ct值為縱軸，繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)。再以待測(cè)樣品的Ct值從標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)上推算出樣品DNA濃度的log值，再通過(guò)樣品DNA濃度的log值推算出其濃度。
2. 如果把本試劑盒用于定性檢測(cè)，只判斷陽(yáng)性或陰性，則陰性對(duì)照必須無(wú)Ct或Ct大于或等于35。陽(yáng)性對(duì)照必須有熒光對(duì)數(shù)增長(zhǎng)，有典型擴(kuò)增曲線(xiàn)，Ct值應(yīng)該小于35，否則實(shí)驗(yàn)無(wú)效。如果實(shí)驗(yàn)有效，則分析待測(cè)樣品，如果無(wú)Ct或Ct大于或等于35，則為陰性。如果Ct小于35則為陽(yáng)性。
自備試劑
超純水，樣品DNA
運(yùn)輸及保存
低溫運(yùn)輸，-20℃保存，有效期2年
自備試劑
超純水，樣品DNA
運(yùn)輸及保存
低溫運(yùn)輸，-20℃保存，有效期2年
